南宋末年，江南少年楊過自小父母雙亡，被父親生前結義兄弟、江湖上有名的大俠郭靖送到天下道教正宗的全真教去學武。全真教教規森嚴，天性叛逆的楊過在教中吃盡苦頭，終于逃出全真教。被活死人墓中的小龍女收留爲徒。師徒二人在墓中一起練武、一起長大，漸生情愫。

但師徒通婚違背宋朝禮教，二人愛情不能爲世俗所容，其間嘗盡聚合離散之苦，楊過更得知了父親身死的事实，但在國仇家恨的權衡中明白了更多。楊龍二人的感情一再波折，終分離十六年。

二人十六年後重逢，無限欣喜……楊過帶著小龍女離開深淵，前往襄陽。楊過以高強武功，于萬軍之中殺死蒙古皇帝，蒙古大軍頓時崩潰，在襄陽就要失守時解了襄陽十六年的圍困。經此一役，神雕俠侶天下揚名，楊過卻帶著小龍女悄然隱退……