《北庭和高昌研究》是一本有關北庭和高昌故地研究的專著。本書分八個部分：一為北庭地區史研究，；二為北庭地區古城遺址研究，如可汗浮圖城、別失八裡、唐輪台等地研究，以及烏孫西遷後活動地域和赤穀城方位，唐代弓月城和元代阿力麻裡城方位考；三為高昌概說；四為高昌地區古城址研究；五為高昌地區墓葬壁畫、紙畫、伏羲女媧圖和俑之研究。三、四、五收已刊佈論文，其中高昌故城一文增補較多。六為北庭和高昌地區回鶻佛寺考古研究，除收入已刊論文外，新撰寫《北庭高昌回鶻佛寺遺址形制溯說》一文；七為唐代北庭和西州地區交通線研究，北庭地區交通線研究在《北庭史地研究》交通部分基礎上進行增補和改寫；八為吐魯番學、北庭學及北庭故城保護規劃問題，因與《北庭和高昌研究》密切相關故亦收錄。