《四聖心源》闡發《內經》、《難經》、《傷寒論》、《金匮要略》諸書蘊義。 是一部包括中醫基本理論和部分臨床醫學的綜合性著作。 黃元御按自己的“之”字治學方法，從黃帝、岐伯、張仲景和秦越人的醫學觀點出發，撰寫一部進一步闡明《傷寒論》內在含義的著作。 他的學術思想源於「四聖」，對臟府病理、生理的認識，重視脾胃中氣的升降合宜。 他指出：「人與天地相參也。 陰陽肇基，有祖氣，祖氣者，人之太極也。 “他認為髒氣的升降功能都取決於中氣，因此，主張”中氣之治“。